Епархиальные отделы
Отдел религиозного образования и катехизации Карасукской епархии
Руководитель: иеромонах Мелхиседек (Свистелин)
Миссионерский отдел Карасукской епархии
Руководитель: протоиерей Андрей Гусев
Епархиальный отдел по церковной благотворительности и социальному служению
Руководитель: протоиерей Александр Лупарев (духовник Епархии, руководитель кабинета по реабилитации алкогольных и наркозависимых граждан)
Заместитель руководителя: протоиерей Евгений Зверев
Епархиальный отдел по координации деятельности церковных структур в медицинских учреждениях
Руководитель: иеромонах Мелхиседек (Свистелин)
Епархиальный отдел по делам молодежи Новосибирской епархии
Руководитель: иерей Николай Иванов
Епархиальный отдел по взаимодействию с Вооруженными Силами и казачеством
Руководитель: иерей Илия Березовский
Отдел по тюремному служению Карасукской епархии
Руководитель: иерей Михаил Прут
Комиссии
Епархиальная Попечительская Комиссии по материальной и социальной поддержке священнослужителей, церковнослужителей и работников религиозных организаций Русской Православной Церкви, а также членов их семей
- протоиерей Александр Лупарев – председатель
- протоиерей Евгений Зверев – заместитель председателя
- Рогозина Елена Викторовна – секретарь комиссии (главный бухгалтер епархиального управления)